三江源地区包括青海省南部的果洛藏族自治州玛多、玛沁、达日、甘德、久治、班玛6县；玉树藏族自治州称多、杂多、治多、曲麻莱、囊谦、玉树6县；海南藏族自治州的兴海、同德2县，黄南藏族自治州的泽库、河南2县，以及格尔木市管辖的唐古拉山乡，共计16个县、127个乡镇，总面积为363124km²，占青海省总面积的50.3%。

三江源自然保护区行政区划图