三江源地区包括青海省南部的果洛藏族自治州玛多、玛沁、达日、甘德、久治、班玛6县；玉树藏族自治州称多、杂多、治多、曲麻莱、囊谦、玉树6县；海南藏族自治州的兴海、同德2县，黄南藏族自治州的泽库、河南2县，格尔木市管辖的唐古拉山乡，总面积为363124km²，占青海省总面积的50.3%。

    三江源区地域辽阔、地势复杂、经济欠发达，交通状况比较落后。公路建设起步晚，标准低，路况差。保护区内部以车便道为主。现有宁果、倒邦、青藏（109国道）、青川（214国道）等主干公路从部分实验区通过或保护区外围经过。保护区涉及的各县县城和部分乡（镇）所在地有省道或一般公路连接。保护区内大部分行政村不能通车或不能常年通车。

三江源自然保护区交通图